在寺廟中除住持外,還設有四大班首,八大執事等。四大班首是指導禅堂或念佛堂修行的;八大執事是專管全寺各項事務的。四大班首即首座、西堂、後堂、堂主。首座由住持聘請年高德劭的尊宿擔任,為全堂修行的模范,掌禅堂中號令之權。八大執事是監院(庫房負責人)、知客(客堂負責人)、僧值(又叫糾察)、維那(禅堂負責人)、典座(廚房、齋堂負責人)、寮元(雲水堂負責人)、衣缽(方丈室負責人)、書記。監院綜理全寺事務,掌管全寺經濟。知客掌管全寺僧俗接待事宜。僧值管理僧眾威儀。維那掌管宗教儀式的法則。典座管理大眾飯食齋粥。寮元管理一般雲游來去的僧侶。衣缽輔助住持照應庶務,調和人事。書記職掌書翰文疏。八大執事都是每年一任,由住持任命之。
藏蒙喇嘛寺院的組織為:“赤巴”,即戒行高深,經典娴熟的住持,是寺中最高領導人,三、五年一任;較小寺院叫“堪布”。其下有掌經喇嘛,叫做“翁則”,負誦經課程及解釋疑義之責。鐵棒喇嘛,叫做“格果”,負督察喇嘛勤情,有懲罰喇嘛及維持佛法之責。法神喇嘛,名叫“接巴”,負決疑卜筮之責。“根察”負統籌全寺事務,監察全寺出納。管家喇嘛,叫做“根巴”,掌管寺內財產及收支事宜。充本喇嘛,叫做“涅巴”,負經管貿易之責。